野生的黄斑地图龟生活在美国密西西比州的帕斯卡古拉河，这是唯一一处发现了黄斑地图龟的地方。这是一条正在饱受污染的河，恶劣的环境给沿岸以及河内的野生动物带来了严峻的生存考验。

　　黄斑地图龟分布于美国密西西比州的帕斯卡古拉河水系。本种为帕斯卡古拉河中占有优势的龟种。它们与阿拉巴马地图龟、红耳滑龟、甜甜圈龟以及刀背麝香龟一起分享着这片栖息地。底部铺有沙子和石块，流速缓慢的河流。尤其喜欢河道内堆满枝叶残骸和树木盘根错节的河段。

　　黄斑地图龟正在田纳西水族馆充满浮游生物的水中游泳。在野生环境中，它们只栖息在美国密西西比河帕斯卡古拉河中，特别是在河流南段居多。这一种群自从卡特里娜飓风导致大批死亡后，仍未恢复生机。地图龟通常会被急速驶过的高速快艇辗死。而在运输河道清理障碍物时，人类留给这种动物晒太阳的地方已经所剩无几。