(一)收集证据过程中要注意以下几点：
1、在收集证据过程中，还应注意运用各种现代科学技术手段，以提高办案工作的质量和效率；
2、收集证据要严格遵照法定的程序，严禁刑事逼供和以威胁、引诱、欺骗以及其他非法方法收集证据；
3、还应当注意保护当事人(包括被告人和被害人)的各种合法权利。例如，对被害患者的隐私不能随便泄漏，以避免造成对其不应有的伤害。
(二)医疗事故案件中，除了被告人供述，被害人陈述，证人证言及专家鉴定结论之外，还需要注意收集以下几方面的书证或物证：
1、门诊及住院病历。
门诊病历是患者来医院就诊时最原始的证据材料，上面记载了病人的主诉、医生的查体、诊断及最后的处理意见等。住院病历包括病程记录、死亡病历讨论记录、 会诊意见、上级医师查房记录、 抢救结束后补记的病历资料等。门诊及住院病历是病情 发展 和医疗活动的真实记录，是认定医疗过失的重要依据。
2、化验单及各类检查结果。
化验单及各辅助科室的检查结果，如心电图、脑电图、B超结果、X片等，这些资料是医生诊断时的重要参考 ，对于认定医疗事故也具有很大价值。
3、处方、药品及药品包装袋。
有的医疗事故是由于医疗人员用错药、发错药导致的，而患者当时所服用药品的处方笺的底方及其复印件、剩余药液及药品包装袋等。在此类案件中极具证明力，故患者及其家属应注意保存。
4、手术中的切除组织。
手术中切除组织是证明有关手术失误的最重要的证据之一，如有条件，应尽可能保存。
5、输血、输液反应的剩余液。
因输血、输液反应而引起的医疗事故在实践中占有相当比例，这些案件中最重要的证据就是剩余液，故患方在输血或输液发生后，应注意保存静脉点滴剩余液和剩余的血液。
6、死者尸体。
对于导致患者死亡的医疗事故案件而言，死者尸体是最有力的证据。因此，对那些因不明的案件，应尽量动员患者家属及时进行尸检，以查清医方对患者的死亡是否负有责任。
上述有关医疗事故案件的证据，有的保存在患者手里，如门诊病历及门诊X光片、CT片等，但更多的则被医院以档案形式保存。司法人员在调查取证工作中，应尽可能取得患者和医疗单位的配合和支持。