1、一级市场：网上申购网下配售
投资者在一级市场投资公司债时，网上认购一般是按时间优先的原则实时成交，即先进行网上申报的投资者的认购数量将优先得到满足，交易系统将实时确认成交。当网上累计的成交数量达到网上发行的预设数量时，网上发行即结束。当网上发行预设数量认购不足时，剩余数量将一次性回拨至网下发行。

在上证所上市的企业发行公司债，原则上采用网上发行和网下发行相结合的方式。网上发行是将一定比例的公司债，按确定的发行价格和利率，通过本所竞价交易系统面向社会公众投资者公开发行。公司债券网上发行的具体事务，由公司债券的主承销商牵头安排。试点期间，上证所对公司债券网上发行不收取发行手续费。网上发行以1000元面值为一个认购单位，按时间优先的原则确认成交后，由中国证券登记结算有限责任公司按其业务规则进行清算、注册。参与发行认购的投资者应使用在中国证券登记结算有限责任公司开立一个证券账户。
网上资金申购按照现行新股资金申购上网发行业务模式办理，并实行T3日(T日指销售机构在规定时间受理投资人申购、赎回或其他业务申请的工作日)申购资金解冻的资金申购上网定价发行流程。网上资金申购中，有效申购总量少于原定采取网上资金申购发行规模的剩余部分采用其他方式发行。网上分销部分，在分销期间内主承销商可在设定的价格区间内或以固定价格在本所挂牌分销。在分销期内，深交所交易系统从上午9:15开始接受申购委托，按报盘申购价格优先、时间优先的原则确认成交。向上市公司股东优先配售按照现行新股增发中的老股东优先配售业务模式办理。优先配售后剩余部分可采用其他方式发行。网下发行由参与网下申购的机构投资者向保荐人(主承销商)报送网下申购订单进行申购，发行人和保荐人(主承销商)根据网下申购订单簿记建档情况对所有有效订单进行配售。

2、二级市场：竞价交易当日回转

就二级市场交易而言，个人投资者目前还只能在竞价交易系统中进行公司债买卖。公司债现券当日买入当日卖出，即实行T0交易制度。

上证所公司债券现货交易可在上证所竞价交易系统和固定收益证券综合电子平台同时进行，并使用相同的证券代码和证券简称。公司债现货交易按证券账户进行申报，并实行净价交易、全价结算。公司债现货在该电子平台采取报价交易的，每笔买卖报价数量为1000手或其整数倍，报价按每1000手逐笔进行成交。当日通过竞价系统买入的公司债，可于当日通过该系统卖出，也可于次一交易日通过该竞价系统卖出。电子平台的一级交易商可向上证所申请，对在电子平台挂牌的公司债券进行做市及办理与其客户的协议交易。