尿路结石形成的原因及其机制是非常复杂的，目前普遍认为结石不是某以单一原因的疾病，而是多种因素促进的结果。能够引起尿路结石的因素主要有以下几个方面：

环境因素

气候炎热地区的居民，或是经常在高温环境中工作的人群，因为多汗而尿少，导致尿液中的成石物质的超饱和度增高，因此患有尿路结石的人较多。

钙性结石的形成还可能与土壤及水中的镁、锶、铜等抑制物的含量低有关。

饮食因素

成年人肾脏和输尿管结石与营养条件有关，营养条件越好，特别是动物蛋白质及精致糖进食含量高，以及纤维素进食量少的人群中，尿路钙性结石的患病率高。

小儿膀胱结石与营养不良，特别是与缺少乳、蛋和动物脂肪有关。饮水量少以致尿量少的人容易患尿石症，过度摄入维生素C、D的人则容易形成钙性结石。

代谢系统紊乱

全身新陈代谢紊乱导致成石物质由尿液中排出过多，就有可能形成相应的结石。

如体内嘌呤代谢紊乱可导致尿酸结石的产生；由于基因缺乏所致的氨基酸代谢失常的人容易形成胱氨酸结石；体内的钙、磷代谢紊乱，尿液中的钙、磷过多，容易在尿路形成钙性结石。

泌尿系统疾病

各种原因所致的尿路狭窄导致上面的尿路发生淤积，尿液中的成石物质容易发生沉积而形成结石。

此外各种尿路感染，所产生的有机物能够破坏尿液中与结石相关的物质胶体平衡，在胶体平衡被破坏的情况下爱，容易形成结石。

先天性异常

某些先天性因素也可以导致尿路结石的发生，如畸形的肾脏和输尿管由于尿路受到压迫等原因造成尿淤积，容易诱发结石。

尿道异物

正常的尿液中成石物质经常处于超饱和状态，尿路内的异物如导尿管、手术缝线等可形成结晶核，从而促使成石物质沉附在其上而形成结石。

药物因素

磺胺类药物在肝脏经乙酰化而由肾脏排出，但是在酸性尿液中其溶解度很低，所以容易沉淀而形成结石。噻嗪类利尿剂可以使尿酸排出增加而导致结石的形成。

长期卧床

长期卧床即可导致尿液引流不畅而造成尿淤积，容易形成结石，又可导致骨质脱钙，致使尿钙增加，促进结石的形成。