妈祖祖庙祭典在每年农历三月二十三日妈祖圣诞之日举行。

　　祭典背景：

　　妈祖，是中国古代至高无上的海神。按照古礼，凡能御大灾、捍大患和有功大于国家者宜得礼。所以，自南宋以来，历代帝王不仅对妈祖频频褒封，还由朝廷颁布谕祭。元代，曾三次派朝臣代表皇帝到湄洲致祭。明永乐则在南京天妃宫举行御祭，由太常寺卿主持，并配备乐舞。清康熙统一台湾后，又屡次派朝臣诣湄洲致祭。清雍正复诏普天下行三跪九叩礼。

　　“湄洲祖庙祭典”的行祭地点在湄洲祖庙广场或新殿天后广场。祭典全程时间约45分钟，祭典规模可分为大、中、小三种。

　　祭典流程依序为：

　　1、擂鼓鸣炮;

　　2、仪仗、仪卫队就位，乐生、舞生就位;

　　3、主祭人、陪祭人就位;

　　4、迎神上香;

　　5、奠帛;

　　6、诵读祝文;

　　7、跪拜叩首;

　　8、行初献之礼、奏《和平之乐》;

　　9、行亚献之礼、奏《海平之乐》;

　　10、行终献之礼、奏《咸平之乐》;

　　11、焚祝文、焚帛;

　　12、三跪九叩;

　　13、送神、礼成。