自费指的是由个人按照一定比例支付部分的医疗费用。刷医保卡指的是会报销一部分的医疗费用但是需要承担一部分未列入基本医疗保险范畴的费用;使用了基本医疗保险药品目录之外的药品费用;使用了基本医疗保险诊疗项目不予支付部分诊疗项目的医疗费用;超过基本医疗保险医疗服务设施支付标准部分的医疗费用;以及规定不予支付的医疗服务设施发生的费用。两者是在使用医保卡时的两种不同方式，从两者的解释说明来看也是完全不同的。