海门市一般指海门区，是江苏省南通市的市辖区，所以不属于其他区。海门市位于江苏省东南部，长江北岸，东北濒临黄海，南靠长江，全境总面积1148.71平方千米。

海门区境内地势平坦，沟河纵横，地表平均海拔4.96米（以废黄河为基准）。地势呈西北略高、东南偏低，西部最高处海拔5.2米，东部最低处海拔2.5米，南北横截面呈孤形，两头低、中间高。