黑毛藻是鱼缸里比较多见的藻类之一，也是鱼缸中最难清除的藻类，对水草有一定的伤害，影响整个鱼缸的美观。黑毛藻产生的原因多数是因为鱼缸里的生态平衡没有建立好，黑毛藻可以利用所有的可见光进行生存。

在黑毛藻前期，可以放一些可以吃黑毛藻的生物，然后少量喂食。加强换水频率或者用杀菌灯，减少水中孢子类的数量，换水时尽量接近泥面，及时清除粪便，同时还需要把已经有黑毛藻的叶子剪掉，减少扩散。因为过量的生物也是藻类产生的原因。还可以用专门的去除黑毛藻的药剂，但是在使用的时候一定要注意用量，把生物移除出去，或者辅助一些去除磷元素的一些药物。