中华鲟主要以一些小型的或行动迟缓的底栖动物为食，包括虾蟹、鱼类、软体动物和水生昆虫等，因生活环境的不同其食物种类也有所变化，幼鱼在长江中、上游江段主要以摇蚊幼虫、蜻蜓幼虫、蜉蝣幼虫及植物碎屑等为食，到了河口咸淡水域中的幼鱼则以虾类、蟹类及小鱼为食，在长江口外近海水域以鱼、蟹、虾和头足类为食。

温馨提示：中华鲟属于野生保护动物，保护野生动物从自身做起，拒绝买卖野生动物制品，不干扰野生动物的自由生活。目前社会上存在的食用珍贵、濒危野生动物等行为，既是一种社会陋习，也是非法猎捕、杀害珍贵、濒危野生动物活动屡禁不止的原因之一。没有买卖，就没有杀害，杜绝食用野生动物，它们不属于餐桌。