1、出处不同：最初的记载，凤凰是一种实质的动物禽鸟，山海经只是说其很象鸡，而且有五彩缤纷的羽毛。然而这种生物上应于天（宇宙），其一出现，天下即可太平盛世，所以是非常吉祥之物。朱雀是二十八宿的南方七宿（井、贵、柳、星、张、翼、轸）的总称，其形象鸟，位于南方，属火，色赤，亦名“朱鸟”。它的最初起源，目前尚无定论，以文物考查的话，随县出土的战国时期曾侯乙墓漆箱，上面首次记录了完整的二十八宿与的名称，朱雀等四象之名当然也赫然在列了。

2、象征不同：朱雀是传统文化中的四象之一，《三辅黄图》所谓的“天之四灵”之一。从先秦时代开始它就是代表炎帝与南方七宿的神兽，而到了汉代五行学说开始兴起，它的象征含义又多了丙丁与夏季。凤凰，亦作“凤皇”，古代传说中的百鸟之王。雄的叫“凤”，雌的叫“凰”，总称为凤凰，亦称为丹鸟、火鸟、鶤鸡、威凤等。常用来象征祥瑞，凤凰齐飞，是吉祥和谐的象征，自古就是中国文化的重要元素。