1、可有口干、轻度恶心、呕吐、腹胀、便秘、腹泻、腹痛等；丙氨酸氨基转移酶（ALT）、天门冬氨酸氨基转移酶（AST）和胆红素升高也有发生，一般是轻微和短暂的，大多不影响治疗。另有国外资料报道，在使用奥美拉唑长期治疗的患者的胃体活检标本中可观察到萎缩性胃炎的表现。

2、神经精神系统：可有感觉异常、头晕、头痛、嗜睡、失眠、外周神经炎等。

3、禁忌：对奥美拉唑过敏者。严重肾功能不全者。婴幼儿。孕妇、哺乳妇女禁用。