一般出现在Black Warrior River水系的上游和下游，杰佛逊、马歇尔、劳伦斯，沃克尔等地方以及中等大小的小河与宽阔的小溪甚至水坝都是其理想的栖息地。

　　平背麝香龟栖息于水中，是一群非常脆弱的个体，水质的变化会使其生病甚至猝死，近年来，由于环境的不断恶化，一些河流不可避免的遭受着污水的侵袭，这也导致了平背麝香龟数量不断下降，国际交易价格不断攀升。

　　平背麝香龟习惯栖息于中等大小的小河与宽阔的小溪，甚至水坝都是理想的栖息地，虽然平背麝香龟可以生活在不同情况的小溪和湖泊中，他的栖息地更适合于自由流淌的小溪和小河中，并且长有大约2英寸深的水生植被。河面上突起和叠加的岩石都积聚着丰富的软体动物，浅浅淤泥和堆积物，中等的营养成分以及适宜的细菌数量，适当的水温、较低的污染，加上不断有沙子的累积并不会有危害的存在。

　　平背麝香龟害羞、神秘的平背很少晒太阳，偏好于黄昏的微弱阳光和夜晚出来活动，尤其在盛夏时节。在白天幼体比成体更善于活动，雄性比雌性有更大的活动范围。在一个季节内和一个地区内，更多的成体，公龟和母龟活动的范围主要保持在20~30米以内。