1.违法。公司拖欠工资，员工收货款抵工资违法。公司拖欠员工工资，员工应当通过合法的途径追讨，可以向工会求助，可以向劳动监察投诉，可以申请劳动争议仲裁，有欠条的可以直接向人民申请支付令。对公司的货款，员工没有处分权。员工私自扣下货款，是违法行为，是利用职务之便，把公司的财产据为己有，从而强迫公司清偿工资，如果员工不是及时知会公司，或者扣款多余拖欠的额度，则可能构成职务侵占。
2.法律依据：《工资支付暂行规定》第七条 工资必须在用人单位与劳动者约定的日期支付。如遇节假日或休息日，则应提前在最近的工作日支付。工资至少每月支付一次，实行周、日、小时工资制的可按周、日、小时支付工资。
《中华人民共和国劳动合同法》
第三十条 用人单位应当按照劳动合同约定和国家规定，向劳动者及时足额支付劳动报酬。用人单位拖欠或者未足额支付劳动报酬的，劳动者可以依法向当地人民申请支付令，人民应当依法发出支付令。
第八十五条 用人单位有下列情形之一的，由劳动行政部门责令限期支付劳动报酬、加班费或者经济补偿；劳动报酬低于当地最低工资标准的，应当支付其差额部分；逾期不支付的，责令用人单位按应付金额百分之五十以上百分之一百以下的标准向劳动者加付赔偿金：
（一）未按照劳动合同的约定或者国家规定及时足额支付劳动者劳动报酬的；
（二）低于当地最低工资标准支付劳动者工资的；
（三）安排加班不支付加班费的；
（四）解除或者终止劳动合同，未依照本法规定向劳动者支付经济补偿的。