独资企业股份分割分为两种情况，夫妻在合伙企业中的出资以及夫妻一方名义投资的独资企业。具体如下所述：
1、夫妻在合伙企业中的出资，在离婚时如何分割应该说，解释
(二)第十七条规定的基本处理原则是与第十六条公司股份处理基本相同。但由于公司法与合伙企业法的规定不同，特别是公司法规定，公司股权只能转让，不能抽资，而合伙企业可以退伙退资，因此，允许是合伙人一方退伙，由法院处理退伙资产，这一点与公司股权处理不同，其他各点相同。
2、夫妻一方名义投资的独资企业，离婚时如何分割因为不涉及到第三人权益，故处理起来相对简单。解释
(二)十八条规定：
（1）如果一方要企业的经营权，要对企业资产进行评估，后，取得企业一方补偿另一方。
（2）双方如果都要企业经营权，由双方竞价，按出价高的竞价额给另一方补偿。
（3）双方均不愿经营企业的，一般中止离婚案件的审理，告之双方清算注销该企业，如果尚有财产，按共同共有分割。
二、如何注册个人独资企业独资企业，即为个人出资经营、归个人所有和控制、由个人承担经营风险和享有全部经营收益的企业。以独资经营方式经营的独资企业有无限的经济责任，破产时借方可以扣留业主的个人财产。独资企业通常在工商局登记，要经营场地证明。投资人申请设立登记，应当向登记机关提交下列文件：
1、投资人签署的个人独资企业设立申请书(网上下载或到登记处领取)
2、投资人身份证明(投资人身份证复印件)
3、企业住所证明(经营场所房产证或者房屋租赁合同)
4、国家工商行政管理局规定提交的其他文件(如果涉及行政许可要提供批准证明)