1、超出政府批示面积
农村最在乎的房子越大越好，不管是房间还是整体面积，因此也就出现了实际建房的面积超过审批面积的情况，这种“超标”的房子自然是没办法办理“房产证”的。
注：所谓“超标”就是向政府申请报建递交的材料图纸注明的面积是这么多，但实际建房时的面积超过申请时注明的面积。
2、违章建筑：没有报建经政府批示、私建的房子
3、非本集体成员（或城镇户口），在农村流转宅基地建造房屋或购买房屋的
不是本村本大队的成员，但通过转让或者购买等手段获得宅基地后建房的，可能无法办理房产证。因为相关法律法规的规定，此类宅基地属于违规。
4、买别人的房子，但没有办过户手续
有的农民朋友出于各种原因，花钱买了别人家建的自建房，但因为手续麻烦或不重视手续等问题，最终没有办理过户手续，导致了房屋产权关系上出现歧义。