建筑工程合同纠纷和普通的民事纠纷相比，具有如下的一些特点：
第一，法律关系比较复杂。在实践中，我国的建筑工程制度运行是非常混乱的，违法发包、分包、转包、挂靠等现象比比皆是。我国制定了最为严格的建筑工程法律制度，但是却有着最差的执行力度，违法现象司空见惯，极为普遍。在我办理的建筑工程合同纠纷案中，我还未见过严格按照我国的建筑工程法律制度执行的工程。
第二，对于法官和律师专业性要求非常高。因为建筑工程纠纷不同于普通的民事纠纷，除了大量的建筑法律、法规之外，还涉及到非常专业的建筑工程施工问题。不熟悉建筑公司运行，不熟悉建筑施工，没有办理过大量的建筑工程合同纠纷案件的法官和律师是无法精确找到根本问题的。
第三，证据繁多。因为是建筑工程合同纠纷，证据往往避免不了招投标文书、施工合同、监理日志、施工日志、索赔和签证函、会议纪要等等。
第四，标的额相对比较大。