与分公司签合同由总公司付款，具体由分公司还是总公司付款也可以在签署的劳动合同之中约定。签署的合同之中应该包括以下内容：
①合同应做到内容合法、条款齐全、文字清楚、表述规范、权利义务和违约责任明确、期限和数字准确，应包括：
1、合同名称
2、甲乙方名称及地址，经办人联系电话
3、甲乙方法定代表人或其合法代理人签字、合同专用章
4、合同签订日期
5、标的(内容)
6、数量、质量
7、价款或酬金(工程计价方法、工程款支付方式)
8、履约方式、地点、费用的承担
9、违约责任(甲乙方权利和义务)
10、生效、失效条件
11、争议解决的方法
12、合同的份数及附件
13、保密条款(视合同性质需要
14、质量保修协议书
15、安全协议书
16、廉政协议书。
②设立分公司应该提交的材料包括哪些
1、《企业设立登记申请书》《企业设立登记申请表》、《投资者名》、《企业负责人登记表》、《企业经营场所证明》等表格
2、《名称预先核准申请书》及《企业名称预先核准通知书》
3、《指定(委托)书》
4、总公司拨款证明
5、公司对分公司负责人的任命文件，负责人不是本地的需要提供暂住证复印件
6、加盖公司公章的《企业法人营业执照》复印件。