菌血症通常不会自愈，菌血症大多是由细菌进入血液和繁殖引起的，细菌从哪里进入血液和感染病灶是否清除是菌血症能否治愈的关键原因。

菌血症早期及时治疗可以治愈，延误治疗可能危及生命，菌血症患者易导致多器官转移性感染，如呼吸道感染和消化道感染，严重者可并发急性心内膜炎、化脓性心包炎和腹膜炎等。应在医生的指导下使用抗生素，根据细菌培养和药敏试验结果调整抗生素，伴有脓肿和坏死等并发症，应根据病情给予抗生素和手术治疗。

经过及时的抗生素治疗和手术治疗菌血症是可以治愈的，但如果延误治疗，如心包炎、心内膜炎和腹膜炎等疾病可能会危及生命。

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