有几个原因：

1.手动变速箱和发动机的结构与自动变速箱不同。最明显的就是手动挡有离合器，自动挡没有。而且，两者的原理不同。这也导致了不可互换性。

2.一辆车出厂的时候，它的所有设计都处于最完美的状态，发动机之间的所有零件都是匹配的。如果强行改动，必然会影响内部结构和安全。

3.最后，最重要的一点，国家法律有明文规定，禁止你改变你的车的内部结构。

附《道路交通安全法》第二章第十六条：

任何单位和个人不得有下列行为：

1.擅自拼装机动车或者改变机动车已登记的结构、构造或者特征的；

2.变更机动车型号、发动机号、车架号或者车辆识别代码的；

3.伪造、变造或者使用伪造、变造的机动车登记证书、号牌、行驶证、检验合格标志和保险标志；

4.使用其他机动车的登记证书、号牌、行驶证、检验合格标志和保险标志。