花椒籽的用途有：榨花椒籽油、做为调料使用。

花椒籽是四川菜中使用最多的调料，常用于配制卤汤、腌制食品或炖制肉类，有去膻增味作用。亦为“五香粉”原料之一。

花椒籽油是利用花椒的副产物花椒籽仁为原料，通过现代油脂生产工艺及先进设备精制而成，是一种富含α—亚麻酸的高级保健食用油和添加剂，既可当普通调和油烹饪使用，也可添加在各类食品中。花椒籽油富含人体必需的不饱和脂肪酸，其中被专家称为“脑黄金”的α—亚麻酸含量高达30%以上。α—亚麻酸是人体所必需多不饱和脂肪酸，是构成人体组织细胞的重要成份，是人体健康所必需的物质。