公司账户被冻结的原因：

法院检察院冻结（民事诉讼中，法院依法地方裁定冻结）；

政府相关机构或司法机关的冻结（单位因涉嫌犯罪）；

公司存在和银行的财务纠纷（银行向法院申请冻结）。

公司账户被冻结后的通常处理办法：

通知需要知悉此事的公司高层、财务人员、主要业务经理，以免再往公司账户里打款。通知范围需要控制，以免引起人心浮动。

告知即将为公司打款的客户，协商现金收款，或者打到出纳人员的个人账户里。

确定冻结原因，若存在经济纠纷可以庭外和解，将银行账户解冻。