长期佩戴染色玛瑙会对身体造成很大的伤害，会损伤人体器官，破坏人体的中枢神经系统，对人体器官造成损伤。还会破坏人体免疫系统，因为染色玛瑙上的有毒物质具有强烈的腐蚀性。

1、致癌

有的染色玛瑙是用化学染料染色的，这种化学染色的玛瑙通常含有重金属，且重金属的含量普遍超标，长期佩戴这种染色玛瑙会致癌，并可能会诱发基因突变，对身体有很大的伤害。

2、损伤人体器官

玛瑙染色所使用的药水的主要成分为硝酸钾、硝酸钠、硝酸银等剧毒物质。这些物质不仅容易被人体所吸收，还会破坏人体的中枢神经系统，从而对人体内的器官造成损伤。

3、破坏人体免疫系统

染色玛瑙的染色材料大多具有非常高的腐蚀性，即使经过处理，其表面也还是会残留有毒物质。这些有毒物质长期与皮肤接触会对人体的免疫系统造成一定程度的破坏。