金针菇一般要煮5-10分钟，金针菇中含有秋水仙碱，这种物质溶于水，充分加热可以把它破坏掉，所以金针菇必须完全煮熟再食用。金针菇常做火锅食材，也经常拿来煲汤，因为金针菇不好消化，所以制作时可以切碎一点，防止卡在喉咙里。

煮金针菇一般是水沸腾后煮5-10分钟，煮的时候可以撕成小份，方便煮熟。新鲜金针菇中含有秋水仙碱，这种物质会氧化变成有毒的二秋水仙碱，二秋水仙碱会刺激胃肠粘膜，人大量食用后会引发恶心、干呕、发热、便血等症状。

因为秋水仙碱极易溶于水，高温下也可被破坏，所以家中做金针菇是会提前用清水浸泡金针菇，还要彻底加热。金针菇可以用盐水浸泡，浸泡后沥干放入塑料袋中密封保存，这样可以延长金针菇的保存时间，以防变质。

金针菇常用作火锅食材，也可用来煲汤，常见的汤排骨汤、西红柿鸡蛋汤、鱼丸香菇汤等。因为金针菇嚼不烂，而且很长，所以做汤时可以切碎一点，特别是给小孩和老人吃的时候，太长会卡在喉咙里，也不好消化。