初创企业股权分配方式有：

第一、按照出资额比例分配，出资是股权分配的依据，根据出资额与占总出资额比例进行股权分配，这种方式可能使得每位出资人获得股权比例有多有少。

第二、股权协商分配方式。两位股东，一个出资60%，一个出资40%，但股权进行平均分配。平均分配方式可能会削弱公司创始人的控制力而影响公司决策。

【法律依据】《公司法》第四条，公司股东依法享有资产收益、参与重大决策和选择管理者等权利。