单子叶植物的根系是须根系，主根不发达。而双子叶植物的根系大部分都是直系，主根比较发达。

另外单子叶植物的叶片比较狭小，一般都和根茎秆处于竖立的形态，表面的角质很厚，表面积小。双子叶植物的叶子大多数都是平伸的形态，而且面积比较大，叶子表面的角质层很薄。

双子叶植物的种子里有两枚子叶，由于植物体的各个习性都不同，所以茎中的维管束呈环状的形态排列，并有形成层。这样的形态可以使得茎再次加粗，叶子中具有网状的叶脉，花瓣部分的数量通常以4或5为基数，使得主根发达，所以形成了直根系。双子叶植物根据恩格勒系统被分为两种亚纲，有离瓣花亚纲和合瓣花亚纲，这两者之间的主要区别可以通过观察是否有花被、花被已经结合或者分离来确定。