红曲又名紫色红曲霉，菌丝体大量分枝，初期无色，渐变为红色，老后紫红色，菌丝有横隔，多核，含橙红色颗粒，成熟时在分枝的顶端产生单个或成串的分生孢子。

分生孢子褐色，（6-9）μm×（7-10）μm。在另外菌丝顶端还产生橙红色单个球形子囊壳，闭囊壳橙红色，近球形，直径25-75μm，内含多个子囊。子囊球形，含8个子囊孢子，成熟后子囊壁消失。子囊孢子卵形或近球形，光滑、透明、无色或淡红色，（5.5-6）μm×（3.5-5）μm。