经过多年的人工改良和杂交繁殖，燕鱼有了许多新的种类，根据尾鳍的长短，分为：短尾、中长尾、长尾三大品系;而根据鱼体的斑纹、色彩变化又分成好多种类，在国内比较常见的有：白神仙鱼、黑神仙鱼、灰神仙鱼、云石神仙鱼、半黑神仙鱼、鸳鸯神仙鱼、三色神仙鱼、金头神仙鱼、玻璃神仙鱼、钻石神仙鱼、熊猫神仙鱼、红眼神仙鱼等等，而最近在国外比较风行的埃及神仙鱼在国内还不多见。

　　燕鱼的雌雄鉴别在幼鱼期比较困难，但是在经过8-10个月进入性成熟期的成鱼，雌雄特性却十分明显，特征是：雄鱼的额头较雌鱼发达，显得饱满而高昂，腹部则不似雌鱼那么膨胀，而且雄鱼的输精管细而尖，雌鱼的产卵管则是粗而圆。由于神仙鱼是属于喜欢自然配对的热带鱼类，配对成功的神仙鱼往往会脱离群体而成双入对的一起游动、一起摄食，过着只羡鸳鸯不羡仙的独立生活。