亚马逊泥龟稚龟阶段背甲毫无特点，黑色的背甲上呈现出一些简单的纹路，这样的色彩使得其并不会受到大众的瞩目，但是成年后的亚马逊泥龟外观变化很大，背甲呈现出辐射状的黄色。

　　亚马逊泥龟体长在27.5厘米左右，具有三条脊椎龙骨的背甲普遍较长，呈明显的黑色，后方缘盾无锯齿。一些个体的脊椎骨发展的较为完整，但也许比其它的来得更加的扁平，或并不存在于年老个体的背部。

　　亚马逊泥龟雄性腹甲凹陷，尾巴长而粗，末端有钩状的刺，后腿表面的内侧有两排较浓密的缀片联结物，体长在15.5厘米左右，相对与雌性的17.5厘米的长度显然是小了些。雌性的腹甲平坦而饱满，尾巴较短。

　　亚马逊泥龟头部与颈部的顶端通常是棕色或褐色，同时也夹杂着一些时而明亮时而暗淡的斑纹，从图片上来看，黄色的纹路居多。咽喉部位有类似于乳头状的突出物。外壳一般是褐色及棕色，野生的个体往往附着着绿色的藻类。背甲呈明显的拉伸而且相对来说比较高，通常包含了23块缘盾，顶部有时略微的凹陷或平坦，有一条不明显的脊椎沿着背甲中央向下直至边缘。