(一)委托商标代理机构办理的，申请人可以自愿选择任何一家在商标局备案的商标代理机构办理。所有在商标局备案的商标代理机构都公布在“代理机构”一栏中。
(二)申请人直接到商标注册大厅办理的，申请人可以按照以下步骤办理：
准备申请书件→在商标注册大厅受理窗口提交申请书件→在打码窗口打收文条形码→在交费窗口缴纳申请规费→查收是否予以撤销注册商标的决定书
申请撤销连续三年停止使用注册商标有两条途径：
(一)委托在商标局备案的商标代理机构办理。
(二)申请人直接到商标局的商标注册大厅办理。
申请书件的准备
申请人办理撤销连续三年停止使用注册商标申请，应提交以下书件：
1、撤销连续三年停止使用注册商标申请书(应注明撤销理由);
2、直接到商标注册大厅办理的，提交申请人经盖章或者签字确认的主体资格证明文件(营业执照副本、身份证等)复印件。委托商标代理机构办理的，提交申请人的主体资格证明文件(营业执照副本、身份证等)的复印件;
3、直接到商标注册大厅办理的，提交经办人的身份证原件和复印件(原件经比对后退还);委托商标代理机构办理的，提交商标代理委托书。
查收是否予以撤销注册商标的决定书
商标局收到撤销申请后，将向商标注册人发出关于提供注册商标使用证据的通知。商标局收到商标注册人提供的注册商标的使用证据后，将对证据进行审查，作出是否予以撤销该注册商标的决定，并向注册人和申请人发出是否予以撤销注册商标的决定书。如果是委托商标代理机构办理的，商标局则将是否予以撤销注册商标的决定书邮寄给该商标代理机构。
注意事项
1、申请人的名称、地址、邮政编码及电话号码等联系方式必须填写清楚、准确，以便于联系。
2、申请人在提交申请前应查询该撤销商标的注册情况，以该商标的现注册人情况填写《撤销连续三年停止使用注册商标申请书》。
3、申请人应按照《商标法实施条例》第三十九条第二款的规定，在撤销理由中说明被申请商标连续三年停止使用的有关情况。
4、被申请撤销的商标自核准注册之日起至撤销申请日至少已满3年。
5、当事人对商标局做出的决定不服的，可以在收到撤销决定之日起15天内向商标评审委员会申请复审。