出现这种问题的主要原因有以下几种：

1．接种时袋温过高，造成菌种死亡。接种后48小时不萌发，测量袋温在32℃以上，这种情况应及时将袋温降至30℃以下，在杂菌感染前，及时补接菌种，用种量要大。

2．灭菌不彻底。这种情况一部分菌袋萌发正常，一部分菌袋萌发不良，另一部分菌袋不萌发；肉眼观察，不萌发的菌袋袋料色泽浅，发黄；解开袋口有酸味。对不萌发的菌袋和已染杂的菌袋，应及时扎紧袋口回锅重蒸；如果接种时间超过l周，料的pH值降至5.5以下，应重新倒袋，加入30%新料，调整pH值到10重新装袋回锅；对萌发不良，生长缓慢的菌袋，应加强管理，增加松口或刺孔次数，增加给氧量，菌丝一般都能长满菌袋，只是满袋时间稍有延长。

3．菌种质量不合格。菌种生产过程中受热，造成菌种死亡或生命力下降，引起菌种不萌发或萌发不良。确诊后，在杂菌感染前，选用合格菌种加大用种量朴接，感染后的菌袋应重新扎紧袋口，回锅后补接。